青海雨花石的种类主要品种有：
玛瑙：按颜色分有红、蓝、绿、紫、青、白、酱斑、金黄以及浆水玛瑙、五色锦屏玛瑙等，其中以蓝玛瑙、金黄玛瑙较稀见。
水晶：除无色水晶外，雨花石中含有烟晶、茶晶、黄晶、蔷薇水晶、紫晶、鬃晶、髪晶等，以后三种观赏效果较好，紫晶形端色鲜者为珍品。
玉髓：亦称石髓，雨花石中常见的有葡萄状、钟乳状的，色彩以灰白、乳白居多，也有少量的呈鲜红、深红、葱绿诸色，火红极艳者，较为难得。
蛋白石：青海雨花石中的蛋白石，质纯，色艳，极具润感，如雾如烟，扑朔迷离，有单色也有复色，色彩极具柔和感，有两种色彩的蛋白石，色与色之间浑然天成。
化石：青海雨花石中的化石有动物化石、植物化石，以珊瑚化石居多，一般以有色彩，硅化程度高，形象居于石之平面的为佳品。
